W czerwcu 2010 r. Stanisław Gawłowski, Sekretarz Stanu w Ministerstwie Środowiska, podpisał zaktualizowany dokument Organizacja systemu oceny projektów indywidualnych w zakresie osi priorytetowych I, II i III. Dokument określa zakres wymaganej dokumentacji aplikacyjnej, etapy oceny wniosków o dofinansowanie oraz tryb postępowania w przypadku odrzucenia wniosku o dofinansowanie w odniesieniu do projektów znajdujących się na Liście projektów indywidualnych.